Опубликовано 15 Июня 2026

https://mintrans.gov.ru/press-center/news/12755

В соответствии с информацией, предоставленной Федеральной налоговой службой Минтрансу России по вопросу рисков отказа налоговых органов в случаях отсутствия экспедиторов в реестре экспедитора, Министерство сообщает. При условии своевременной подачи уведомления юридическим лицом или индивидуальным предпринимателем, осуществляющим транспортно-экспедиционную деятельность, в Реестр уведомлений о транспортно-экспедиторской деятельности и невключении в установленный срок по независящим от него причинам (отсутствие решения и отказа в регистрации в реестре), налоговыми органами автоматические отказы в принятии расходов для налогообложения прибыли организаций и вычета налога на добавленную стоимость клиентам осуществляться не будут.

Временное отсутствие сведений о компании в реестре не будет считаться нарушением, если есть доказательства того, что уведомление было подано в установленный срок. 

Новое обязательное требование о регистрации экспедиторов в реестре действует с 1 марта 2026 года, и все организации должны учитывать его при работе с контрагентами.

Согласно разъяснениям ФНС, само по себе отсутствие сведений в Реестре о юридическом лице или индивидуальном предпринимателе, осуществляющем транспортно-экспедиторскую деятельность и оказывающем транспортно-экспедиторские услуги налогоплательщику, не влечет риски негативных налоговых последствий для заказчиков (клиентов) в части признания расходов для целей налогообложения прибыли организаций, а также зачета сумм налога на добавленную стоимость по операциям с экспедиторами, статус которых в Реестре не подтверждён на дату совершения операции, при условии наличия доказательств надлежащего исполнения экспедитором обязанности по подаче уведомления в Реестр.

Налоговые органы анализируют совокупность обстоятельств, в частности, подтверждающих реальность факторов хозяйственной деятельности и отсутствие искажений сведений о хозяйственной деятельности, указанных в статье 54.1 Налогового кодекса РФ.

В случае возникновения необходимости и в рамках, предусмотренных Налоговым кодексом РФ и Положением о Федеральной налоговой службе, ФНС России будет осуществлять свои полномочия через деятельность территориальных налоговых органов. Эти действия будут выполняться в контексте исполнения положений ФЗ № 140-ФЗ «О внесении изменений в Федеральный закон «О транспортно-экспедиторской деятельности» и отдельные законодательные акты Российской Федерации». 

Ранее Минтранс России давал разъяснения относительно реестра уведомлений о транспортно-экспедиторской деятельности в контексте переходного периода. В частности, ведомство пояснило, что меры ответственности за невключение экспедитора в реестр не применяются, если участник рынка своевременно подал уведомление в уполномоченный орган и может подтвердить этот факт документально.

Речь идет о случаях, когда уведомление было направлено через портал Госуслуг в установленные сроки, с фиксацией даты и времени приема, но внесение сведений в реестр задержалось по причинам, не зависящим от заявителя. К таким причинам могут относиться технические сбои, высокая нагрузка на государственные сервисы или несоблюдение сроков рассмотрения уведомлений уполномоченным органом. При этом механизм защиты распространяется только на добросовестных заявителей и не применяется, если экспедитор представил заведомо недостоверные или неполные сведения либо допустил иные признаки злоупотребления правом.

Такой подход позволяет учесть сжатые сроки переходного периода, отраслевые особенности транспортно-логистического рынка и возможные внешние препятствия при подаче уведомлений. Таким образом Минтранс России создаёт справедливые условия для участников транспортно-логистического рынка при внедрении единого окна взаимодействия участников перевозочного процесса и государства.

ФНС не будет отказывать в налоговых вычетах, если экспедитора не включили своевременно в реестр по независящим от него причинам

https://trans.ru/news/fns-ne-budet-otkazivat-v-nalogovih-vichetah-esli-ekspeditora-ne-vklyuchili-svoevremenno-v-reestr-po-nezavisyaschim-ot-nego-prichinam

15 июня 2026 г.15:42

Федеральная налоговая служба (ФНС) России не станет отказывать в вычетах налога на добавленную стоимость (НДС) и в признании расходов для целей налогообложения прибыли организаций, если транспортно-экспедиционная компания не включена в реестр экспедиторов по независящим от нее причинам. Такие разъяснения налогового ведомства опубликованы на сайте Министерства транспорта РФ. Это значит, что компания должна была вовремя подать заявление на регистрацию в реестре и может доказать это соответствующим уведомлением с портала госуслуг с фиксацией даты и времени приема заявки. Напомним: сам обязательный реестр экспедиторов в России запустили с 1-го марта этого года. Зарегистрироваться в нем необходимо было в течение двух месяцев, однако из-за обилия заявок Ространснадзор не успел обработать все обращения, в результате чего экспедиторам и дали отсрочку. В целом же, без регистрации в реестре транспортно-экспедиционные компании в принципе не могут на законных основаниях осуществлять свою деятельность.

«Согласно разъяснениям ФНС, само по себе отсутствие сведений в Реестре о юридическом лице или индивидуальном предпринимателе, осуществляющем транспортно-экспедиторскую деятельность и оказывающем транспортно-экспедиторские услуги налогоплательщику, не влечет риски негативных налоговых последствий для заказчиков (клиентов) в части признания расходов для целей налогообложения прибыли организаций, а также зачета сумм налога на добавленную стоимость по операциям с экспедиторами, статус которых в Реестре не подтвержден на дату совершения операции, при условии наличия доказательств надлежащего исполнения экспедитором обязанности по подаче уведомления в Реестр», — сказано в сообщении Министерства транспорта РФ.

Речь идет о тех случаях, когда экспедитор в установленные сроки, до 30-го апреля 2026-го года, направил через портал госуслуг заявление на регистрацию в реестре, однако пока не включен в него из-за задержек с обработкой заявок со стороны Ространснадзора — оператора реестра.

При этом добросовестное исполнение своих обязанностей экспедитор может подтвердить уведомлением о принятии заявки с фиксацией даты и времени.

Правда, такое послабление будет действовать только до тех пор, пока Ространснадзор не обработает все заявки. Как только это произойдет, экспедиторы, не включенные в реестр (из-за подачи ложных данных, несовпадения сведений и т.п.), не смогут на законных основаниях продолжать работу на рынке, а их клиенты, как следствие, не смогут рассчитывать на налоговые вычеты.

Пока ни в Министерстве транспорта РФ, ни в Ространснадзоре не сообщали о завершении обработки всех заявок. Однако на данный момент в реестре уже зарегистрировано более 62 тыс. экспедиторов.

Обязательный реестр экспедиторов запустили в России с 1-го марта 2026-го года. При этом действующим компаниям и ИП для регистрации в нем дали переходный период в 60 календарных дней. Вот только из-за большого количества заявок, поступивших в сжатые сроки, Ространснадзор, оператор реестра, не успел обработать все запросы, после чего экспедиторов, не включенных в реестр, но подавших заявку, временно освободили от ответственности.